Елена В. Кузмич, Aлександр Л. Алянский, Ольга Макаренко, Вероника Ермолина, Светлана Мерзлякова, Светлана Тяпушкина, Анна Насрединова, Наталья E. Иванова, Людмила С. Зубаровская, Борис В. Афанасьев
НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р. М. Горбачевой, кафедра гематологии, трансфузиологии и трансплантологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета им. Павлова, Санкт-Петербург Россия
Резюме
Введение
Целью нашего исследования был анализ частот аллелей HLA и пятилокусных HLA-гаплотипов при оценке методом секвенирования высокого разрешения у доноров, обследованных в Регистре доноров костного мозга при Первом Санкт-Петербургском государственном медицинском университете им. И. П. Павлова.
Материалы и методы
Исследованная когорта составила 1000 доноров. Высокоразрешающее HLA-типирование проводили путем моноаллельного секвенирования по Сэнгеру, с применением реагентов, полученных от фирмы Protrans (Германия), программный продукт Sequence Pilot, version 4.1.2 был получен от JSI Medical Systems (Германия). Анализ данных проводился С помощью программы «Арлекин», версия 3.5. Алгоритм ожидания-максимизации использовали для определения частот пятилокусных гаплотипов.
Результаты
Анализ результатов пятилокусного типирования 1000 доноров позволил выявить наиболее частые аллели HLA и определить пятилокусные гаплотипы HLA высокого разрешения, установить наличие редких аллелей HLA, описать три новых аллеля HLA системы. Новые аллели HLA получили официальные названия: B*44:02:45, DQB1*02:85, DRB1*01:01:30, согласно классификации Комитета ВОЗ по номенклатуре факторов HLA системы (November 2016). Редкие аллели, обнаруженные в исследованной группе были следующими: HLA-A*02:460, HLA-A*31:66, HLA-B*08:138. Наиболее частые аллели HLA у доноров в нашем регистре представлены на Табл.1. Наиболее частыми гаплотипами системы HLA при пятилокусной детекции методом высокого разрешения являются: A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQB1*02:01 (3,4%); A*03:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQB1*06:02 (3,1%).
Заключение
Применение высокоразрешающего типирования для определения фенотипов HLA в регистре доноров может позволить сократить сроки поиска неродственных доноров и, кроме того, дает возможность выявления полиморфизмов системы HLA.
Ключевые слова
Трансплантация костного мозга, типирование HLA, высокое разрешение, регистр доноров.