Аберрантное метилирование промоторных областей генов sox7, p15ink4b и антагонистов сигнального пути WNT у больных миелодиспластическим синдромом
И. И. Кострома, С. В. Грицаев, Ж. Ю. Сидорова, С. А. Тиранова, С. П. Свитина, Ю. С. Дрижун, И. С. Мартынкевич, К. М. Абдулкадыров, С. И. Капустин, А. В. Чечеткин
Российский НИИ гематологии и трансфузиологии, Санкт-Петербург, Российская Федерация
Резюме
Введение
Эпигенетические нарушения, включая метилирование генов-супрессоров опухоли, рассматриваются как один из ключевых механизмов развития миелодиспластического синдрома (МДС). Целью работы было выявление ассоциации статуса метилирования генов SOX7, p15INK4b, SFRP1, SFRP4 и SFRP5 с отдельными клинико-гематологическими показателями и общей выживаемостью (ОВ).
Пациенты и методы
Проанализированы данные 46 больных МДС с медианой возраста 67,5 года. Диагноз устанавливали по классификации ВОЗ. Статус метилирования генов изучали методом метилспецифичной ПЦР.
Результаты
Аберрантное метилирование одного и более генов обнаружено у 43 больных (93,5%). С наибольшей частотой выявлялось метилирование SOX7 у 84,8% больных, SFRP1 у 71,7% больных и p15INK4b у 54,3% больных. Метилирование одного, двух, трех, четырех и пяти генов одновременно имело место у 10,9%, 28,3%, 26,1%, 19,6% и 8,7% больных, соответственно. Доли больных с аберрантным метилированием SFRP1, SFRP4, SOX7 и p15INK4b в группах, выделенных по уровню
бластов в костном мозге, не различались. Метилирование гена SFRP5 было более частой находкой у больных рефрактерной анемией с избытком бластов (РАИБ): 43,5% против 13,0% у больных без избытка бластов; OR=5,1, 95%CI: 1,2-22,3, p=0,047. У больных без избытка бластов чаще выявлялись случаи с 0-1 метилированным геном: 26,1% против 8,7% у больных РАИБ. В то же время, в группе больных РАИБ повышение количества бластов с 5-9% до 10-19% сопровождалось увеличением числа случаев с 3-5 метилированными генами. В общей группе не обнаружено корреляции числа метилированных генов с возрастом, количеством бластных клеток в костном мозге и вариантами кариотипа. Увеличение числа метилированных генов не влияло на ОВ.
Выводы
Полученные данные свидетельствуют об увеличении объема эпигенетических нарушений по мере прогрессии МДС в виде повышения числа генов с аберрантным метилированием, в частности, гена SFRP5.
Ключевые слова
Миелодиспластический синдром, метилирование, гены, soХ7, p15ink4b, sfrp1, sfrp4, sfrp5
